(no subject)

[latentbird]

Мы используем в своей работе одну идею, которая красива (на мой вкус, разумеется), но настолько неочевидна с первого взгляда, что мне приходится объяснять ее себе каждый раз, когда она приходит мне в голову.

А именно: если есть некий механизм, срабатывающий на наличие определенного периодического сигнала, пусть неполного, то и в случайной последовательности он обязательно сработает, даже если там нет видимой периодичности, потому что это механизм сигнал там все равно найдет.


Мы занимаемся картированием нуклеосом,(nucleosomes то есть не совсем картированием, но поисками сигнала, который скажет гистонам (histones), куда им, собственное, садиться. Так вот, известно, что нуклеосомы образуются даже на абсолютно случайной последовательности. Известно также, что нуклеосомный сигнал очень слаб. То ли это периодичность АА/ТТ с периодом витка ДНК вокруг нуклеосомного ядра, то ли это более общий паттерн (точнее, его части). В любом случае сигнал вырожден. А это значит, что гистоны узнают даже его малую часть, то есть сочетание двух-трех нуклеотидов и через некий промежуток еще двух-трех. При четырехбуквенном алфавите ДНК даже в случайной последовательности встретятся участки, удовлетворяющие этому паттерну. То есть сигнал не видно, но он там есть...


Это я к тому, что журнал нам снова статью на доработку вернул